В мультике "Евангелион 1.11: Ты не один" на Землю обрушилась страшная катастрофа, множество людей погибло. При этой катастрофе на планету заселились ужасные существа. Тогда Икари Синдзи, которому всего 14, был отправлен в город - крепость. Прибыв в Токио - 3, он сразу должен приступить к пилотированию Евангелиона, это робот, созданный для борьбы с пришельцами. Икари боится, что не справится с управлением и поэтому говорит об отказе садиться в машину. Единственная, кто способен справиться с это задачей, тяжело ранена. Получится ли у главного героя справиться с испугом и помочь своей планете в борьбе с ужасными существами, способными погубить человечество.