Из-за ученого Хелла человечеству грозило вымирание. Кодзи, робот Зэд и их верные товарищи покончили с ужасным амбициями безумного доктора и смогли вернуть людям мир, спокойствие и радость.С тех жутких дней миновало масса лет. Главный герой решил пойти по стопам любимого отца. Парень стал исследователем. В процессе нелегких трудов, герой сталкивается с довольно необыкновенной формой жизни на территории Фудзи. Загадочная встреча сулит угрозу и очередные испытания ждут человечество, будущее которого зависит от Мадзингера. Как будут развиваться события в дальнейшем?