События фильма «Годзилла: Минус ноль» разворачиваются в Японии во второй половине сороковых годов, через два года после операции «Вада‑Цуми». Казалось, что Годзилла окончательно уничтожен, но монстр возвращается, и для Коичи Сикисимы и Норико Оиси это означает новое испытание. Мало того, по слухам, ядерные испытания американских военных стали причиной того, что чудовище не только пробудилось, но и стало силнее. Теперь оно пересекает Тихий океан, угрожая Америке. А в Японии пробуждается еще одно древнее существо под Аокигахарой у подножия горы Фудзи. Возможно, что Годзилла, будучи его давним врагом, передумает и вернется, чтобы уничтожить противника.