Главная героиня сериала «Призраки моря» – океанолог Абигель, которая прибывает в свой порт после загадочного крушения траулера и исчезновения четырнадцати моряков. Судно принадлежало ее отцу, и возвращение в город становится для женщины личным делом. Абигель вскоре приходит к выводу, что в регионе происходят странные аномалии, влияющие на навигационные приборы и выводящие их из строя. Чем глубже она погружается в исследования, тем больше море начинает показывать пугающие явления. Постепенно Абигель осознает, что за чередой катастроф может стоять что-то такое, о чем неизвестно современной науке. Это расследование превращается для главной героини в противостояние со страшной тайной…