События фильма «Вторжение похитителей тел» разворачиваются в Сан-Франциско, где на улицах города появляются странные цветы. Как раз в это время многие жители мегаполиса начинают как-то странно себя вести. Владелица грязелечебницы Нэнси вечером делает обход территории и в одной из кабинок обнаруживает человеческое тело. Женщина открывает деверь и видит, что это монстр, но спустя мгновение существо принимает облик ее мужа. Нечто подобное происходит с инспектором Мэтью, а потом он узнает о Нэнси. Обдумав происходящее, Мэтью приходит к выводу, что дело в странных цветах, и он пытается привлечь внимание мэрии, но там, кажется, заняты другими делами. Тем временем в Сан-Франциско появляются все новые и новые клоны людей…