Главный герой сериала «Пустые города» – бывший сотрудник полиции Виктор Пугачев, который стал изгоем в родном Северонефтянске. А все дело в том, что Виктор привез сюда инфекцию, которая привела к эпидемии. Из-за болезни умерло и несколько сослуживцев Виктора. Начальник уголовного розыска подполковник Давид Егизарян вынужден был уволить Пугачева из-за общественного давления. Теперь в отделе остались неопытные новички Тележкин и Ясенева. А ситуация в городе ухудшается, вот-вот Северонефтянск полностью закроют на карантин. Егизарян обеспокоен, что этим воспользуется криминалитет, и тогда он решает вернуть опытного Пугачева на службу. Официально устроить в полицию главного героя не получается, поэтому Виктор начинает служить в качестве дружинника.