В центре сюжета мультфильма «Ночь в зоопарке» – милый белый кролик, который оказывается в эпицентре фантастических событий. Происходит нечто странное: на зоопарк падает меленький кусочек метеорита из далекого космоса, а любопытный кролик проглатывает его и превращается в неведомое чудище. Монстр хочет захватить зоопарк, а всех его обитателей сделать жуткими гибридами. Чудище начинает создавать неведомых гибридов из гориллы и рыбы, зебры и оленя, слона и змея. Никто из обитателей зоопарка не может остановить это безумие. И только храбрый лев, которого чудище хочет смешать с диким кабаном, решает дать отпор…