События фильма «Над темной водой» разворачиваются в Ленинграде одним летом конца шестидесятых годов. Главные герои – молодые люди из богемной тусовки: поэт Сергей, художник Владимир и оператор из Ленфильма Лев. В Ленинграде белые ночи, товарищи прогуливаются по набережной Невы и снова спорят о творчестве. Там они случайно знакомятся с наивной провинциальной вчерашней выпускницей школы Леной, которая приехала в этот город поступать в ВУЗ. Каждый из друзей внезапно влюбляется в провинциалку чуть ли не с первого взгляда. Мало того: каждый из них делает Лене предложение руки и сердца. Кого из главных героев выберет Лена? Останутся ли Владимир, Сергей и Лев после этих событий друзьями?