Главные герои мультсериала «Люди Икс» – Циклоп, Росомаха, Разбойник, Гамбит, Джин Грей и их руководитель профессор Икс. Все эти люди обладают фантастическими способностями из-за особенного генетического кода. Они мутанты, но называют себя людьми Икс. Группа мутантов прячется от простых людей, понимая, что человечество их не оставит в покое. Они поддерживают друг друга, вот только долго скрываться не получается. Заговорщики узнают о существовании Людей Икс и создают для борьбы с ними мощных роботов-Стражей. Так начинается большая война между человечеством и мутантами. Мультсериал является экранизацией комиксов начала девяностых годов Джима Ли, где поднимаются разные социальные проблемы и вопросы: христианство, Холокост, СПИД, одиночество и другие.