Главные герои фильма «Красивые деревни красиво горят» – два лучших друга, десятилетние мальчики из югославской провинции. Серб Милан и его друг мусульманин Халил, которые растут бок о бок, вместе ходят в школу и сидят за одной партой, познают мир и просто радуются жизни. Как и все мальчишки, Милан и Халил бродят по окрестностям родной деревни, но там есть одно место, куда они страшно боятся зайти – жуткий каменный туннель, о котором местные детишки выдумали десятки страшилок. Проходит десять лет, Югославия в огне, а лучшие друзья оказываются по разные стороны баррикад. В дни ожесточенной войны каждому из них предстоит оказаться в том страшном тоннеле. Группа сербских партизан и Милан оказываются заблокированными в тоннеле, а рота, в которой служит Халил, пытается взять врага штурмом…