Сюжет «Ментовские войны. Харьков 2 сезон» продолжает повествование про борьбу, в центре которой находятся честные и справедливые оперативники, оказывающие жестокое сопротивление преступной среде, произрастающей в родном городе главных героев. В историю ввязаны не только закоренелые представители криминального мира, но и скрывающие под маской собственные лица представители высокого статуса, именуемые как «оборотни в погонах». Андрей Гордиенко — сильный духом мужчина, до некоторого времени занимающий руководящую должность в уголовном розыске, а впоследствии переведенный в районное отделение, где ему предстоит нести службу в качестве простого оперативника. На новом месте работы герою оказывают не совсем радушный прием, сопровождаемый с особым недоверием и отталкивающим отношением, но этот факт совершенно не беспокоит квалифицированного специалиста, знающего свое дело, посему он безукоризненно берется за серию расследований в компании своих бывших товарищей, а по совместительству верных друзей. Так Андрей, Богдан и Дмитрий находятся в попытках мести лицемерам, состоящих в числе чиновников, которые падки на коррупцию.